MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV03

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009341	GCG	2	6	138	143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
2	NC_009341	CGG	3	9	192	200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
3	NC_009341	ACC	2	6	210	215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226198
4	NC_009341	ACCC	2	8	223	230	25 %	0 %	0 %	75 %	145226198
5	NC_009341	CG	3	6	306	311	0 %	0 %	50 %	50 %	145226198
6	NC_009341	ATC	2	6	350	355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226198
7	NC_009341	GTT	2	6	372	377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145226198
8	NC_009341	AGC	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226198
9	NC_009341	GCG	2	6	401	406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
10	NC_009341	CGG	2	6	434	439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
11	NC_009341	GCG	2	6	461	466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
12	NC_009341	GTC	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226198
13	NC_009341	GCGG	2	8	525	532	0 %	0 %	75 %	25 %	145226198
14	NC_009341	CGG	2	6	603	608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
15	NC_009341	CCG	2	6	684	689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226198
16	NC_009341	ACC	2	6	698	703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226198
17	NC_009341	GCAC	2	8	761	768	25 %	0 %	25 %	50 %	145226198
18	NC_009341	GCCACC	2	12	774	785	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145226198
19	NC_009341	CCG	2	6	815	820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226198
20	NC_009341	TAG	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226198
21	NC_009341	AC	3	6	846	851	50 %	0 %	0 %	50 %	145226198
22	NC_009341	TGA	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226199
23	NC_009341	CGT	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
24	NC_009341	GCG	3	9	1358	1366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226199
25	NC_009341	TGC	3	9	1374	1382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
26	NC_009341	GCG	2	6	1387	1392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226199
27	NC_009341	CTT	2	6	1397	1402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145226199
28	NC_009341	GGC	2	6	1416	1421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226199
29	NC_009341	CCG	2	6	1428	1433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226199
30	NC_009341	GC	3	6	1438	1443	0 %	0 %	50 %	50 %	145226199
31	NC_009341	GCT	2	6	1486	1491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
32	NC_009341	TGC	2	6	1499	1504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
33	NC_009341	CCT	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226200
34	NC_009341	TC	3	6	1534	1539	0 %	50 %	0 %	50 %	145226200
35	NC_009341	GT	3	6	1620	1625	0 %	50 %	50 %	0 %	145226200
36	NC_009341	GCC	2	6	1646	1651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226200
37	NC_009341	TCA	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226200
38	NC_009341	CGG	2	6	1855	1860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226200
39	NC_009341	GCC	2	6	1869	1874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226200
40	NC_009341	GTC	2	6	1934	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226200
41	NC_009341	GC	3	6	1946	1951	0 %	0 %	50 %	50 %	145226200
42	NC_009341	TCG	3	9	2112	2120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226200
43	NC_009341	CTG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226200
44	NC_009341	CGA	3	9	2170	2178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226200
45	NC_009341	TGG	3	9	2221	2229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226200
46	NC_009341	CG	3	6	2419	2424	0 %	0 %	50 %	50 %	145226201
47	NC_009341	CGC	3	9	2437	2445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
48	NC_009341	GCC	2	6	2471	2476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
49	NC_009341	GCC	2	6	2478	2483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
50	NC_009341	GCT	2	6	2487	2492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226201
51	NC_009341	CCG	2	6	2545	2550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
52	NC_009341	GGC	2	6	2563	2568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
53	NC_009341	GCG	2	6	2569	2574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
54	NC_009341	ATG	2	6	2615	2620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226201
55	NC_009341	GCG	2	6	2621	2626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
56	NC_009341	ACGGC	2	10	2627	2636	20 %	0 %	40 %	40 %	145226201
57	NC_009341	AGA	2	6	2678	2683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145226201
58	NC_009341	GGC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
59	NC_009341	CGC	2	6	2772	2777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
60	NC_009341	GGCG	2	8	2778	2785	0 %	0 %	75 %	25 %	145226201
61	NC_009341	GCA	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226201
62	NC_009341	AG	3	6	2981	2986	50 %	0 %	50 %	0 %	145226201
63	NC_009341	TG	3	6	3001	3006	0 %	50 %	50 %	0 %	145226201
64	NC_009341	GAC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226202
65	NC_009341	ATC	2	6	3157	3162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226202
66	NC_009341	AGC	2	6	3203	3208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226202
67	NC_009341	GGC	2	6	3271	3276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226202
68	NC_009341	GCC	2	6	3289	3294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226202
69	NC_009341	CGA	2	6	3300	3305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226202
70	NC_009341	ACT	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226202
71	NC_009341	GTC	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226202
72	NC_009341	GGCG	2	8	3358	3365	0 %	0 %	75 %	25 %	145226202
73	NC_009341	AGTGC	2	10	3470	3479	20 %	20 %	40 %	20 %	145226202
74	NC_009341	CTT	2	6	3492	3497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145226202
75	NC_009341	CGC	2	6	3500	3505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226202
76	NC_009341	GCC	2	6	3518	3523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226202
77	NC_009341	TGC	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226202
78	NC_009341	AGG	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226202
79	NC_009341	GTG	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226202
80	NC_009341	AGA	2	6	3744	3749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145226202
81	NC_009341	CGG	2	6	3843	3848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
82	NC_009341	CCG	2	6	3850	3855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226203
83	NC_009341	CGG	2	6	3869	3874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
84	NC_009341	GTG	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226203
85	NC_009341	ACCG	2	8	3907	3914	25 %	0 %	25 %	50 %	145226203
86	NC_009341	TGA	2	6	3973	3978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226203
87	NC_009341	CTG	2	6	4038	4043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226203
88	NC_009341	CGA	2	6	4064	4069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226203
89	NC_009341	GGC	2	6	4184	4189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
90	NC_009341	GTG	2	6	4251	4256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226203
91	NC_009341	CGG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
92	NC_009341	ACC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226203
93	NC_009341	AGG	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226203
94	NC_009341	CTCGAT	2	12	4567	4578	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145226204
95	NC_009341	ATTG	2	8	4580	4587	25 %	50 %	25 %	0 %	145226204
96	NC_009341	GCC	2	6	4672	4677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226204
97	NC_009341	AGT	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226204
98	NC_009341	GC	3	6	4735	4740	0 %	0 %	50 %	50 %	145226204
99	NC_009341	CTC	2	6	4765	4770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226204
100	NC_009341	CCG	2	6	4830	4835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226204
101	NC_009341	GCG	2	6	4875	4880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226204
102	NC_009341	CGG	2	6	4907	4912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226204
103	NC_009341	CGG	2	6	4926	4931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226204
104	NC_009341	AGA	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145226204
105	NC_009341	AGC	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226204
106	NC_009341	ACG	2	6	5079	5084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226204
107	NC_009341	TGG	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226204
108	NC_009341	CGA	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
109	NC_009341	CGA	2	6	5230	5235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
110	NC_009341	GC	3	6	5261	5266	0 %	0 %	50 %	50 %	145226205
111	NC_009341	CGG	2	6	5268	5273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226205
112	NC_009341	GCG	2	6	5284	5289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226205
113	NC_009341	CTGGA	2	10	5297	5306	20 %	20 %	40 %	20 %	145226205
114	NC_009341	GC	3	6	5342	5347	0 %	0 %	50 %	50 %	145226205
115	NC_009341	CCG	2	6	5380	5385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226205
116	NC_009341	GATCA	2	10	5408	5417	40 %	20 %	20 %	20 %	145226205
117	NC_009341	AGG	2	6	5421	5426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226205
118	NC_009341	TGG	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226205
119	NC_009341	CTT	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145226205
120	NC_009341	TGA	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226205
121	NC_009341	TGC	3	9	5667	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226205
122	NC_009341	CGCC	2	8	5694	5701	0 %	0 %	25 %	75 %	145226205
123	NC_009341	ACG	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
124	NC_009341	TG	3	6	5738	5743	0 %	50 %	50 %	0 %	145226205
125	NC_009341	GAC	2	6	5822	5827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
126	NC_009341	CTG	2	6	5873	5878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226205
127	NC_009341	TCG	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226205
128	NC_009341	CG	3	6	6026	6031	0 %	0 %	50 %	50 %	145226206
129	NC_009341	CGC	2	6	6039	6044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226206
130	NC_009341	CAC	2	6	6237	6242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226206
131	NC_009341	CAA	2	6	6300	6305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145226206
132	NC_009341	GC	3	6	6382	6387	0 %	0 %	50 %	50 %	145226206
133	NC_009341	CGCA	2	8	6447	6454	25 %	0 %	25 %	50 %	145226206
134	NC_009341	GCCC	2	8	6480	6487	0 %	0 %	25 %	75 %	145226206
135	NC_009341	CACGT	2	10	6515	6524	20 %	20 %	20 %	40 %	145226206
136	NC_009341	GCC	2	6	7095	7100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226207
137	NC_009341	CCT	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226207
138	NC_009341	CCA	2	6	7111	7116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226207
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140	NC_009341	CTG	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226207
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142	NC_009341	TCG	2	6	7184	7189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226207
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158	NC_009341	CCG	2	6	7915	7920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226208
159	NC_009341	GAG	2	6	7974	7979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226208
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172	NC_009341	ACGGA	2	10	8326	8335	40 %	0 %	40 %	20 %	145226208
173	NC_009341	CAC	2	6	8344	8349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226208
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253	NC_009341	GTAG	2	8	11172	11179	25 %	25 %	50 %	0 %	145226210
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262	NC_009341	GCC	2	6	11725	11730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226210
263	NC_009341	GCG	2	6	11789	11794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226210
264	NC_009341	CCA	2	6	11832	11837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226210
265	NC_009341	CGA	2	6	11850	11855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226210
266	NC_009341	CCA	2	6	11856	11861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226210
267	NC_009341	CCG	2	6	11964	11969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226210
268	NC_009341	GAGC	2	8	11979	11986	25 %	0 %	50 %	25 %	145226210
269	NC_009341	GCG	3	9	12014	12022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226210
270	NC_009341	CGG	2	6	12057	12062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226210
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272	NC_009341	CG	4	8	12112	12119	0 %	0 %	50 %	50 %	145226210
273	NC_009341	GCTC	2	8	12144	12151	0 %	25 %	25 %	50 %	145226210
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276	NC_009341	GCGCG	2	10	12264	12273	0 %	0 %	60 %	40 %	145226210
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278	NC_009341	GC	3	6	12319	12324	0 %	0 %	50 %	50 %	145226210
279	NC_009341	CGA	2	6	12384	12389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226210
280	NC_009341	GC	3	6	12442	12447	0 %	0 %	50 %	50 %	145226210
281	NC_009341	GC	3	6	12470	12475	0 %	0 %	50 %	50 %	145226210
282	NC_009341	GCGG	2	8	12484	12491	0 %	0 %	75 %	25 %	145226210
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296	NC_009341	CGT	2	6	13104	13109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226210
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299	NC_009341	GCG	2	6	13145	13150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226210
300	NC_009341	CGT	2	6	13221	13226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226210
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368	NC_009341	GCTC	2	8	16431	16438	0 %	25 %	25 %	50 %	145226213

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.